Nghị định 20/2026/NĐ-CP: 5 ưu đãi thuế đáng chú ý cho doanh nghiệp nhỏ và vừa (SME)

Ngày 15/01/2026, Chính phủ ban hành Nghị định số 20/2026/NĐ-CP, trong đó quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số nội dung của Nghị quyết 198/2025/QH15 về các cơ chế, chính sách đặc thù nhằm thúc đẩy phát triển kinh tế tư nhân.

Nghị định này được đánh giá là bước cụ thể hóa quan trọng để các chính sách ưu đãi của Nhà nước đi vào áp dụng thực tế, với trọng tâm hỗ trợ doanh nghiệp nhỏ và vừa (SME) cũng như doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo.

Dưới đây là những ưu đãi thuế đáng chú ý cho doanh nghiệp SME Thuehkd.vn tổng hợp. 

1. Tổng quan về Nghị định 20/2026/NĐ-CP

Nghị định 20/2026/NĐ-CP được xem là một trong những văn bản triển khai chính sách có phạm vi tác động lớn trong năm 2026, tập trung tháo gỡ rào cản về thuế, đất đai, khoa học công nghệ và nguồn lực hỗ trợ cho khu vực kinh tế tư nhân. 

2. 5 điểm mới nổi bật về Thuế và Hỗ trợ nguồn lực 

Nghị định 20/2026/NĐ-CP cụ thể hóa các nhóm chính sách ưu đãi từ Nghị quyết 198/2025/QH15, tập trung mạnh vào tối ưu nghĩa vụ thuế và gia tăng nguồn lực tài chính cho doanh nghiệp tư nhân. Một số điểm nổi bật gồm: 

2.1. Miễn thuế TNDN 03 năm đầu cho doanh nghiệp vừa và nhỏ đăng ký lần đầu

Theo khoản 3 Điều 7, Nghị định 20/2026/NĐ-CP:  

• Đối tượng áp dụng: Doanh nghiệp nhỏ và vừa được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu. 

• Mức ưu đãi: Miễn 100% số thuế TNDN phải nộp trong thời hạn 03 năm liên tục.

• Cách tính thời gian miễn thuế: Doanh nghiệp nhỏ và vừa được miễn thuế TNDN trong 3 năm liên tiếp, tính từ năm đầu tiên được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu. Trường hợp doanh nghiệp đã được cấp giấy trước thời điểm Nghị quyết có hiệu lực thì chỉ được hưởng ưu đãi cho khoảng thời gian còn lại, không tính lại từ đầu.

• Ưu đãi không áp dụng với: 

• Doanh nghiệp thành lập mới do sáp nhập, hợp nhất, chia, tách chủ sở hữu, chuyển đổi loại hình doanh nghiệp; 

• Doanh nghiệp mới thành lập mà người đại diện pháp luật, thành viên hợp danh hoặc người góp vốn lớn nhất đã từng tham gia điều hành/góp vốn chi phối ở doanh nghiệp khác đang hoạt động hoặc đã giải thể chưa đủ 12 tháng; 

• Thu nhập thuộc diện quy định tại khoản 3 Điều 18 Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp số 67/2025/QH15. 

2.2. Ưu đãi về thuế đối với doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo

2.2.1. Ưu đãi về thuế TNDN

• Đối tượng áp dụng: Công ty quản lý quỹ đầu tư khởi nghiệp sáng tạo, doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo và các tổ chức trung gian hỗ trợ khởi nghiệp đổi mới sáng tạo, có thu nhập từ hoạt động khởi nghiệp, đổi mới sáng tạo theo quy định của pháp luật.

• Mức ưu đãi: Theo quy định tại khoản 1, Điều 10 Nghị quyết 198/2025/QH15 (Miễn thuế TNDN trong thời hạn 2 năm và giảm 50% số thuế phải nộp trong 4 năm tiếp theo)

• Cách tính thời gian miễn thuế: Thời gian miễn, giảm thuế được tính liên tục từ năm đầu tiên phát sinh thu nhập chịu thuế từ hoạt động khởi nghiệp, đổi mới sáng tạo. Trường hợp trong 3 năm đầu kể từ khi có doanh thu nhưng chưa phát sinh thu nhập chịu thuế, thì thời gian miễn, giảm thuế được tính từ năm thứ tư.

2.2.2. Ưu đãi về thuế TNCN

• Đối tượng áp dụng: Chuyên gia và nhà khoa học có thu nhập từ tiền lương, tiền công tại các đơn vị thuộc hệ sinh thái đổi mới sáng tạo như Doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo, trung tâm nghiên cứu và phát triển, các tổ chức trung gian hỗ trợ khởi nghiệp.

• Mức ưu đãi: Miễn 100% thuế TNCN trong 02 năm đầu và giảm 50% số thuế TNCN phải nộp trong 04 năm tiếp theo. 

• Cách tính thời gian miễn thuế: Thời gian miễn, giảm thuế tính liên tục kể từ tháng phát sinh thu nhập được miễn, giảm thuế. Trường hợp phát sinh thu nhập trong tháng thì thời gian tính miễn, giảm thuế được tính đủ tháng. 

• Trường hợp phát sinh thêm thu nhập ngoài doanh nghiệp khởi nghiệp và sáng tạo: Số thuế TNCN được miễn hoặc giảm được tính theo tỷ lệ giữa phần thu nhập được miễn/giảm và tổng thu nhập tiền lương, tiền công trong kỳ.

2.3. Ưu đãi thuế đối với hoạt động chuyển nhượng vốn

Theo khoản 2, Điều 7 Nghị định 20/2026/NĐ-CP quy định: 

• Đối tượng áp dụng: Doanh nghiệp có thu nhập từ chuyển nhượng cổ phần, phần góp vốn, quyền góp vốn, quyền mua cổ phần, quyền mua phần vốn góp vào doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo.

• Mức ưu đãi: Miễn thuế TNDN (đối với tổ chức) và thuế TNCN (đối với cá nhân) khi phát sinh thu nhập từ việc chuyển nhượng vốn góp, cổ phần tại doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo.

• Loại trừ lĩnh vực bất động sản: Ưu đãi này không áp dụng đối với thu nhập từ chuyển nhượng vốn góp, cổ phần tại các doanh nghiệp hoạt động trong lĩnh vực kinh doanh bất động sản.

2.4. Chính sách hỗ trợ tiếp cận đất đai và mặt bằng sản xuất kinh doanh

Theo Điều 4, Điều 5 và Điều 6 Nghị định 20/2026/NĐ-CP:

• Cơ chế hỗ trợ: Nhà nước hỗ trợ vốn đầu tư xây dựng kết cấu hạ tầng khu công nghiệp, cụm công nghiệp, vườn ươm công nghệ theo quy định pháp luật về đầu tư công và ngân sách. Chủ đầu tư không được tính vốn hỗ trợ vào tổng vốn dự án, phải duy tu, bảo dưỡng công trình sau nghiệm thu và bàn giao.

• Về hoàn trả tiền thuê đất: Chủ đầu tư hạ tầng được hoàn trả khoản giảm tiền thuê lại đất cho doanh nghiệp ưu tiên (Doanh nghiệp nhỏ và vừa, khởi nghiệp), với điều kiện doanh nghiệp đã ký hợp đồng, thanh toán và đáp ứng thủ tục.

• Hình thức hoàn trả: Bù trừ nghĩa vụ tài chính hoặc chi trực tiếp từ ngân sách trung ương/địa phương theo tỷ lệ phân chia tiền thuê đất; doanh nghiệp phải hoàn trả nếu vi phạm trong 5 năm đầu (như chấm dứt hoạt động, thay đổi ngành nghề).

• Tiếp cận tài sản công: Việc hỗ trợ thuê nhà, đất là tài sản công phải đảm bảo đúng đối tượng, công bằng, công khai, minh bạch và tuân thủ pháp luật. Trường hợp có nhiều doanh nghiệp cùng đăng ký thuê, việc lựa chọn bên thuê được thực hiện theo nguyên tắc đã quy định. Nguồn tiền thu từ cho thuê, việc quản lý, sử dụng và xử lý vi phạm được thực hiện thống nhất theo quy định hiện hành, đồng thời các cơ quan, tổ chức liên quan phải thực hiện đầy đủ trách nhiệm được giao.

2.5. Đẩy mạnh chuyển đổi số thông qua Quỹ Khoa học công nghệ

Theo Điều 9 Nghị định 20/2026/NĐ-CP đã mở rộng đáng kể biên độ sử dụng nguồn vốn nội bộ, cho phép doanh nghiệp chủ động dùng một phần lợi nhuận trước thuế để hiện đại hóa hệ thống quản trị thay vì chỉ dùng cho nghiên cứu thuần túy.

• Mức trích lập: Doanh nghiệp được trích tối đa 20% thu nhập tính thuế hàng năm để lập Quỹ phát triển khoa học và công nghệ (KH&CN).

• Giá trị thuế: Khoản trích lập này được trừ trực tiếp vào thu nhập chịu thuế khi xác định nghĩa vụ thuế TNDN trong kỳ.

Trong kinh doanh hiện nay, chuẩn hóa công tác kế toán và hóa đơn điện tử đóng vai trò then chốt, giúp doanh nghiệp vừa tuân thủ đúng quy định, vừa kiểm soát hiệu quả doanh thu, chi phí và dòng tiền. Hiện nay, nhiều doanh nghiệp lựa chọn các công cụ hỗ trợ quản lý kế toán và hóa đơn điện tử (ví dụ như Sapo Accounting, Sapo Invoice) để ghi nhận sổ sách rõ ràng, xuất hóa đơn đúng chuẩn và giảm thiểu rủi ro trong quá trình vận hành.

Khi nền tảng quản trị được thiết lập bài bản, doanh nghiệp có thể chủ động tận dụng các ưu đãi chính sách, thay vì bị động xử lý thủ tục hay lo ngại các vấn đề phát sinh về thuế và kế toán. Đây cũng là bước chuẩn bị cần thiết để phát triển bền vững trong giai đoạn chính sách đang thay đổi mạnh mẽ.